Subvenţiile se acordă sub formă de plăţi directe la hectar gestionate de Sistemul Integrat de Administrare şi Control (IACS) şi în cadrul măsurilor de piaţă pentru implementarea mecanismelor comerciale conform Politicii Agricole Comune (PAC). Astfel, Agenţia de Plăţi şi Intervenţie pentru Agricultură administrează sistemul de certificate de export-import şi garanţii pentru importul şi exportul produselor agricole, elaborează şi implementează procedurile privind aplicarea sistemului de intervenţie pentru produsele agricole.

Atribuţiile APIA:

• Asigură derularea operaţiunilor financiare legate de gestionarea fondurilor alocate;
• Asigură verificarea cererilor de plată primite de la beneficiari;
• Autorizează plata către beneficiari în urma verificării cererilor de plată sau îi înştiinţează pe aceştia cu privire la eventualele nereguli sesizate, în vederea soluţionării acestora;
• Execută plăţile autorizate către beneficiari;
• Ţine contabilitatea plăţilor efectuate;
• Urmăreşte încadrarea în fondurile alocate pentru activităţile prevăzute mai sus;
• Asigură îndeplinirea cerinţelor cu privire la informarea publică privind activităţile desfăşurate;
• Asigură desfăşurarea în bune condiţii a activităţilor economice, administrative, contabile, de personal şi audit ale Agenţiei;
• Colaborează pentru îndeplinirea atribuţiilor specifice cu organele administraţiei publice centrale şi locale;
• Pregăteşte şi implementează prevederile privind mecanismele comerciale;
• Administrează sistemul de certificate de export-import şi garanţii pentru importul şi exportul produselor agricole
• Elaborează şi implementează procedurile privind aplicarea sistemului de intervenţie pentru produsele agricole;
• Este autoritatea publică responsabilă cu implementarea Sistemului Integrat de Administrare şi Control;
• Asigură managementul cotelor de producţie de zahăr şi izoglucoză şi gestionează contribuţiile aferente acestor cote;
• Elaborează manuale de proceduri şi metodologii în vederea implementării corespunzătoare a atribuţiilor care îi revin;
• Implementează şi administrează restituţiile la export şi sistemul de garanţii aferente restituţiilor;
• Furnizează toate informaţiile solicitate de Organismul coordonator al agenţiilor de plăţi pentru agricultură, dezvoltare rurală şi pescuit.